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主页 > 测序平台> 单细胞测序 >10x Visium空间转录组测序
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10x Genomics Visium空间转录组测序解决方案可将完整组织切片中细胞的基因表达数据与其所在的空间位置信息相结合,在识别不同细胞群的同时保留其原有的空间位置,这有助于理解肿瘤微环境中细胞功能、表型和位置的关系,其可应用于癌症、神经科学、育生物学等多种研究领域。


研究流程


实验流程,主要分为两大步骤:

1)预实验阶段:

a. 将样本进行冷冻后,使用Optimal Cutting Temperature (OCT)化合物进行组织包埋,且需要进行位置信息标记;

b. 其次根据研究目的,进行冷冻切片制备后,选取部分切片进行RNA质检;

c. 如RNA质检合格后,将进行透化实验- 透化时间的摸索,根据RNA释放的质量和完整性情况,决定后续正式实验中透化的实验条件。

2)正式实验:

a. 将继续完成正式冷冻切片制备,进行甲醛固定,组织透化,HE染色,显微镜拍照成像;

b. 再将组织切片贴合在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上捕获区域,并进行固定和透化,使细胞中的mRNA得到释放,结合到相应的捕获探针上;

c. 将捕获的RNA为模板,进行cDNA合成和文库构建;

d. 对制备好的文库进行DNBSEQ平台测序。




信息分析阶段







DLAB实验室自有Illumina、ABl测序平台、Quanta扫描电镜、Guava流式细胞 仪、IVIS活体成像仪等顶尖设备。可做测序、细胞、动物、病理实验。建有NAS 云和smart云平台

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