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环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,与传统的线性RNA(linear RNA)不同,circRNA分子合呈封闭环状结构,且不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。环状RNA高通量测序服务,可进行环状RNA的鉴定以及环状RNA与miRNA‘’海绵效应‘’分析, 可实现ceRNA(competing endogenous RNAs,内源竞争RNA)机制等研究。可应用在物种环状RNA表达谱构建,环状RNA疾病生物标记开发,环状RNA作用机制研究等方面。
信息分析内容
一、标准信息分析
1. 基本数据统计
1.1去除接头序列、低质量序列得到clean data
1.2与核糖体数据库比对,去除核糖体RNA数据
2. 环状RNA预测鉴定
3. 环状RNA所在线性基因注释
4. 环状RNA在基因组上的定位
5. 环状RNA表达定量分析
6. 样品(组)间表达差异分析
二、高级信息分析
1. 差异环状RNA来源的基因GO功能及富集分析
2. 差异环状RNA来源的基因Pathway功能及富集分析
3. 环状RNA与miRNA互作分析(适用于人/小鼠物种)
DLAB实验室自有Illumina、ABl测序平台、Quanta扫描电镜、Guava流式细胞 仪、IVIS活体成像仪等顶尖设备。可做测序、细胞、动物、病理实验。
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